Isi

• Ikhtisar Perangkat Lunak
• Jenis File yang Didukung
• Ekstensi file primer
• Ekstensi file lain yang digunakan oleh Integrated Genome Browser 9

Versi (per 6/29/2016)	9
Platform
Lisensi	Sumber Terbuka
Kategori	Ilmiah

Info Lebih Lanjut (kunjungi situs web penerbit)

Peringkat: 2.8 / 5 (6 Suara)

Ikhtisar Perangkat Lunak

Fitur utama

• Mendukung berbagai format genom seperti GenBank dan FASTA
• Berinteraksi dengan data dengan animasi zoom dan panning
• Akses dan muat genom dari situs QuickLoad
• Ubah data menjadi berbagai bentuk grafik
• Bagikan data dengan kolaborator melalui Dropbox
• Pasang pengaya untuk fungsionalitas tambahan

Integrated Genome Browser (IGB) adalah program sumber terbuka yang digunakan untuk melihat dan menjelajahi kumpulan data genom yang besar. Anda dapat melihat berbagai format data, berinteraksi dengan data Anda, membuat grafik, menyimpan informasi Anda sebagai gambar, dan membagikan data Anda dengan kolaborator.

IGB memungkinkan Anda untuk melihat data dari anotasi dan urutan yang selaras. Program ini mendukung berbagai format seperti FASTA, BAM, BEDGRAPH, BigWIG, Cytoband, dan GenBank. Anda dapat mengambil data dan mengubahnya menjadi berbagai bentuk grafik termasuk grafik ketidakcocokan untuk menyoroti perbedaan data dan grafik kedalaman untuk menunjukkan cakupan. Anda juga dapat berinteraksi dengan data Anda melalui animasi pembesaran dan panning IGB.

IGB memungkinkan Anda untuk mengakses dan memuat genom dari situs QuickLoad, yang merupakan sistem direktori, urutan, dan file data sederhana lainnya untuk keperluan visualisasi. IGB menyediakan fungsionalitas tingkat lanjut dengan dukungan plugin untuk menambahkan fungsionalitas dan otomatisasi alur kerja melalui penggunaan skrip. IGB juga memberi Anda fitur-fitur canggih untuk membagikan data Anda, apakah itu mempublikasikannya sebagai gambar JPEG, PNG, atau SVG berkualitas tinggi atau menyimpan data di Dropbox untuk memberikan akses kepada kolaborator Anda ke proyek Anda.

IGB terutama digunakan oleh para peneliti universitas, ahli biologi, dan ahli bioinformatika. Ini menyediakan alat canggih untuk membuka berbagai format data genom, memvisualisasikan data sebagai grafik yang berbeda, dan berbagi data dengan kolaborator. Sayangnya, program ini bergantung pada hibah untuk pengembangan berkelanjutan, yang berarti bahwa dukungan untuk aplikasi dapat dihentikan kapan saja. Namun, Browser Genome Terpadu masih merupakan program yang mampu dan dapat disesuaikan untuk pengguna yang ingin menjelajahi dan menganalisis data genom mereka.

Jenis File yang Didukung

Ekstensi file primer

.XML - File XML

Ekstensi file lain yang digunakan oleh Integrated Genome Browser 9

Jenis File yang Didukung
.TEMPAT TIDUR	File Trek Anotasi BED UCSC
.DAS	Sesi Analisis DeltaMaster
.FA	File Urutan Berformat FASTA
.FAS	File Urutan FASTA
.FASTA	File Urutan FASTA
.GB	File Data GenBank
.SGR	File Data Genom SGR
.USEQ	File Data Genom USeq